(4)催蕾、驯养
当床面上有棕色液滴出现时，立即进行催蕾。菇房每天通风2～3次，揭膜通风1～2次，每次20分钟，揭膜应在菇房通风之后进行。1周后即有大量菇蕾发生。为了培养出优质金针菇，在菇蕾出现后要进行驯养。
(5)出菇管理
出菇期间，室温要控制在5～8℃。若生产二级菇，可放宽至5～18℃，高于20℃已分化的幼菇会很快开伞。当子实体长到1～2厘米时，床面薄膜内相对湿度要保持在90%以上，适当喷水。喷水时雾点要细，水量不要大，切勿把水喷到菇柄上，以免菇体染上色斑。随着菇柄伸长，逐渐将薄膜支高。每天通风时，薄膜接头处用大头针别牢，以防通风时将风直接吹到菇体上，而过早开伞。在金针菇生长期间，要给予弱光照，可使菇体成丛生长而不散乱。每天菇房光照时间不超过1小时。
(6)采收
在适当的管理条件下，金针菇生长较快，3～5天就可长到15厘米，符合出口优质菇标准，就应当采收了。10天左右可长到30—40厘米，为内销二级菇。采收时，应成束地将菇柄拔下。采收后，收拾床面腐根及散菇，整平菇床，喷一次水，将塑料薄膜擦净后，重新盖在菌床上。待原基形成后，按上述方法管理。
如是棉籽壳料，一般可采收4～5潮，1～2批菇的质量最好。每百千克棉籽壳可产优质菇50～80千克，二级菇可达80～120千克。
