我国人工栽培金针菇已有百年历史，老的栽培方法是段木栽培，现在几乎全都采用瓶装方法。现将金针菇瓶栽法的具体操作步骤介绍如下：
(1)装瓶
用750毫升菌种瓶或500毫升罐头瓶，将配养料兑水、拌匀，使含水量达60%～65%。培养料装瓶时要下松上紧，料装至瓶肩部，压实，中间用径粗1.5厘米的木棒扎一洞，以利通气，促进菌丝生长。瓶口用聚丙烯膜加盖牛皮纸封口。
(2)灭菌、接种
装瓶后，经高压或常压灭菌，冷却后接种。接种前，接种室（箱）先消毒，然后接种，每瓶原种可接40～60栽培瓶。
(3)培养
将菌种瓶放在20～25℃的培养室内培养。接种后2～3天，菌丝开始恢复生长，8～10天可长到瓶肩以下，20～25天可长满瓶。为使瓶间菌丝生长发育均衡，以利出菇管理，在培养过程中要经常转瓶和移位。菌丝培养期间，室内应保持干燥，空气相对湿度控制在65%以下，这样能有效地降低污染率。
(4)搔菌、催蕾
菌丝长满瓶后，将瓶送入出菇房进行搔菌。搔菌就是将料面的菌种块去掉，操作时用一根8号铅丝砸扁，压弯做成小锄，将料面轻刮一遍。如果不进行搔菌处理，原基大都集中在老菌块上发生，原基数量少，发生也不够整齐。
搔菌后，培养基上面的菌丝接触到空气，很快恢复生长，能在整个培养料表面很整齐地形成大批原基。搔菌时应多准备几把小锄，轮流灼烧灭菌后使用，以免带入杂菌。
催蕾就是搔菌后，不要再盖瓶盖，在瓶口盖湿报纸保湿，室温降至10～12℃，空气相对湿度提高到80%～85%，室内要黑暗。10～14天培养料表面就会出现许多褐色水珠，接着就会形成大量原基。
催蕾期间要经常往报纸上喷水保湿，报纸要平整，没有破洞，不能让水流入瓶内，否则易发生病害。
(5)驯化培养
金针菇子实体在10～12℃时生长最快，但菇柄细长，质量不够理想，产出的菇多为国内市场销售。若要生产优质的出口菇，还需要进行驯化培养。即在原基形成后，将菇房温度降至3～5℃，室内空气相对湿度控制在80%-85%并遮光。
