一、金针菇原种培养基配方
配方一：棉籽皮培养基。棉籽皮90%、麦麸（或米糠）8%、白糖1%、碳酸钙1%、水适量。
配方二：木屑培养基。杂木屑73%、麦麸（或米糠）25%、白糖1%、石膏粉1%、水适量。
配方三：棉籽皮与木屑混合培养基。棉籽皮40%、杂木屑40%、麦麸18%、白糖1%、石膏粉1%、水适量。
配方四：玉米粒培养基，含玉米粒99%、碳酸钙1%、水适量。将玉米粒浸泡吸足水，次日将浸泡过的玉米粒冲洗干净，用锅煮沸30～40分钟，煮到玉米粒膨大变软，但种皮不破裂时捞出。放入筛内沥去水，及时拌入碳酸钙，然后再装瓶、封口。
二、金针菇原种的灭菌
装好的料瓶放入高压锅内灭菌，压力为每平方厘米1.4千克，保持2小时（用常压灭菌时，与栽培料灭菌相同）。
三、金针菇原种的接种
待灭菌后的料瓶冷却后，放入接种箱内进行消毒，方法同上。然后双手伸入接种箱内，同时带入母种试管束，用酒精棉球擦拭双手和母种试管壁，点燃酒精灯，灼烧接种钩后放入酒精瓶内待用。打开母种管棉塞，用火焰灼烧管口，边烧边转。
灼烧均匀后抬起，停在酒精灯火焰上方无菌区内。拿取接种钩，烘干酒精后伸入母种试管，钩取1/5菌种，迅速放入打开口的原种瓶内，再盖好瓶口，进行下一瓶接种。
一般一支母种接4～6瓶原种。接好菌的原种瓶放在25℃左右的培养室内培养。
四、防止杂菌污染原种
培养室在使用前要用3%来苏儿水喷洒消毒，或用甲醛、高锰酸钾混合消毒，以防杂菌污染。菌种培养期间要经常检查，发现污染的瓶子及时处理。在适宜的温度下，经25～30天原种即可长满瓶。
