在双孢菇栽培管理中，覆土也是一项关键的技术。双孢菇子实体必须在覆土后才能扭结形成，而且是在覆土层中扭结长大的。
可以，有时双孢菇覆土后菌丝不上土，这可怎么办呢？
(1)覆土层水分过多
调水过程没有控制好，调水过多过急，水流到培养料内，料面菌丝萎缩或死亡，造成菌丝迟迟不上土。停水打扦，加强通风，使菌丝恢复生长。
(2)水分不足
虽然土表层水分合适，但与培养料表面接触的土层较干，菌丝也无法上土。增加调水量及次数。
(3)土层酸碱度不适宜
覆土时土层的ph值为7.5～7.8，偏酸可喷洒1%～2%石灰水，偏碱可喷洒1%的硫酸铵或2%的过磷酸钙。
(4)土层含有有害物质
覆土被污染或含盐分过多，或者消毒时用药不当等，也会使菌丝不上土。覆土层氨气含量过高，也会使菌丝不上土。经过小面积菌丝爬土试验，确定土层的确含有有害物质时，必须进行换土。如果氨气含量过高，也必须排除氨气或换土。
(5)管理不当
覆土后遇到25℃高温，有的菇农还认为覆土后菌丝上土需要较高温度，关紧门窗并连续喷水，造成菇房缺氧，水浸菌丝产生病变。立即停止喷水，加强通风，并撬动料层通气，让菌丝重新上土。
