双孢菇的覆土就是在双孢菇播种后20天左右，在培养料上覆盖一层厚4厘米的土壤，以利于双孢菇子实体生长。
双孢菇栽培过程中和其他食用菌最大的不同是需要覆土。不覆土则不出菇或很少出菇。
(1)覆土层在料面可以造成一个温湿度较为稳定的小气候，有利于菌蕾的形成。覆土以后，使裸露的料面增加了一层保护层，既能缓和温度的变化，又能降低水分的蒸发。
(2)覆土后改变了料面和土层中二氧化碳和氧气的比例，促进菌丝扭结成子实体。双孢菇菌丝和子实体对二氧化碳的耐受力是有差异的。覆土以后引起料面和土层中二氧化碳含量的变化，从而控制双孢菇菌丝在土层中的生长，及时形成菌蕾。
(3)覆土后改变了营养条件，促进菌丝在营养较差的土层中由营养生长转向生殖生长。双孢菇菌丝在营养丰富的培养料内生长旺盛，当生长到覆土层时由于营养成分含量甚微，生长就受抑制，转向生殖发育而结菇。
(4)覆土对料表菌丝的物理性刺激作用，可促进子实体的形成。这种物理刺激有利于双孢菇菌丝的扭结和分化。
(5)覆土层可随时供给双孢菇生长所需的大量水分。双孢菇生长发育过程中的周期性变化，较其他食用菌更为突出明显。因此出菇旺期需要补充大量的水分，供双孢菇吸收。假如没有土层，料面难以承受这样大量的水分，而土层既能吸收贮存这样多的水分，空隙间又有足够的空气供双孢菇吸收，因而能维持双孢菇的正常生长发育。
(6)覆土层可支持双孢菇子实体的正常生长。双孢菇子实体在裸露的料面上无法正常直立生长，而覆土层却起到了支撑子实体生长的作用。
