食用菌类生长对生态环境的要求极为严格，环境因素的轻微变化，很容易使生理功能受到影响，品质和产量下降。
(1)薄皮菇
表现为菌柄与菌盖间距较大，只有一层菌膜相连，不久即开伞，影响双孢菇质量和缩短贮存期。
发生原因为覆盖土过薄；培养料过薄且发酵不足；通风不良且气温高湿度大；低温空气干燥、料内水分不足；喷出菇水时水量过少；采摘不及时，每潮菇人为控制时间长。
(2)开伞
表现为未成熟的子实体提前开伞。原因可能是气温骤冷骤热，变化过大。在子实体正常发育中，有时气温突然下降到11℃以下，子实体发育缓慢。
当气温突然回升时，暴露在空间的子实体继续发育，而所需的水分、养分难以及时供应，这样就造成了提前开伞。
(3)畸形菇
发生畸形菇的原因比较复杂，如品种因素，头潮菇出菇密，丛生相互积压；覆土过深、过薄，土块过大，土壤质地粒重，通风不良；播种不当、杂菌感染、病害等因素造成料内留存毒素，使菇体发育不均匀；培养料中添加了不当的杀虫剂、杀菌剂；喷水不当，损伤菇体。
(4)死菇
表现为菇蕾萎缩，变黄后死亡。主要原因是气温突然升高，水分蒸发量大，子实体发育过快，水分和营养供应不上，造成子实体原基死亡。及时采取通风降温措施。
