目前国内栽培的许多香菇菌种，大多数是从日本引进来的栽培种。下面我们谈谈香菇菌种怎样保藏，以及如何防止香菇菌种退化等问题。
一、香菇菌种怎样保藏？
(1)斜面低温保藏：常用的方法是，采用pda培养基试管在1～4℃的稳定低温容器中保藏，每3～4个月繁殖一次；或采用同样的低温条件和木屑麦皮培养基，一年更换一次。
(2)液氮保藏：严格按照液氮（-196℃）保藏的有关条件和程序处理，防止菌株受伤害。
二、如何防止香菇菌种退化？
香菇菌种的遗传稳定性是相对的，遗传的变异性是绝对的。菌种发生某些性状向坏的方向变异，称为菌种“退化”。菌种“退化”有遗传造成的原因，也有环境造成的原因。
常见的香菇菌种“退化”现象如菌盖变小、菌肉变薄、菌柄变长出菇期推迟、出菇潮数少、抗逆性差等。但香菇菌种“退化”的机理总体尚不清楚，只有在菌种保藏和使用过程中多加小心。
(1)保藏香菇菌种的条件要稳定、干净。不能将保藏条件悬殊过大的菌种（如香菇与草菇、茯苓等）在同一条件的容器内保存。容器内必须干净，温度必须稳定，不随便开启，尽量少打开保藏菌种容器。
(2)变更培养基保藏，如pda与木屑培养基比较选择使用。
(3)每年进行一次实验室常规性状测试比较，变异较大的菌株停止使用，更换培养基后可以恢复性状的继续使用。
(4)有条件的应成批放入液氮罐保存，每年取出一支或数支试管进行繁殖，恢复繁殖时按常规进行必要性能测试。
