香菇菌袋培养期间，要根据不同生长期观察气温、堆温和菌温的变化，人为加以调节，防止高温危害。
(1)萌发期
接菌后的菌袋，入室头三天为萌发期，菌种块的菌丝处于恢复和萌发阶段，菌温一般比室温低1～2℃，此时室温宜控制在27℃左右，这样能使袋内料温处于菌丝生长最佳温度，有利于菌丝萌发。
(2)生长期
接种4～5天，接菌穴四周可以看到白色绒毛状菌丝时，说明已定植发育。半个月后，通常菌温会比室温高出2～3℃，此时将室内温度调节到25℃为宜。平地摆堆的菌袋可由原来的4袋交叉重叠调整为3袋交叉，使堆温相应降低，防止堆内发生高温。如果室温低于24℃，可以暂缓调整。
(3)旺盛期
养菌20～25天后，菌丝已处于旺盛状态，此时用胶布封口穴的袋应拱起一个豆粒大的通风口，让氧气透进基内。氧气充足的菌丝呼吸加强，代谢活跃，自身产生热量，此时菌温会比室温高出3～4℃。
这阶段如果堆温高于室温，要采取调整堆形，疏松散热，以2袋交叉呈“井”字形堆叠。养菌怕高温，如果菌丝受到高温伤害，将严重影响出菇的质量和产量，甚至绝产。
(4)成熟期
菌丝生长转为旺盛期后，色泽洁白、粗壮，生长速度加快，35天分枝浓密的菌丝会蔓延至整个袋面。随着菌丝生理趋向成熟，菌体表面出现瘤状突起，至51天纽结的瘤状可达2/3。此期温度管理要控制在20～30℃，并要加强通风换气。
另外，要把生长成熟不同的菌袋分类堆放管理。通常在22～25℃条件下，一般品种在55～60天即可达到生理成熟。
