一、木瓜的定干高度问题
木瓜定植后将主干离地60-80厘米处截断（定干），具体高度依栽植密度和所确定的树形而定。密度大、树形小的定干低，相反则高。
第一年在离地40-60厘米的分枝中选留3-4个不同方向的强壮枝作为侧枝，其他长枝疏除，短刺枝保留，除去40厘米以下的分枝和其他徒长枝及根颈下萌蘖。第二年夏季，在各个主枝上选留3-5个强壮枝培养成结果枝组，保留健壮短枝以培育结果枝，以后根据树形需要逐年在中心主枝上选留分枝。
二、如何控制木瓜树冠
木瓜树冠高度应控制在2.5米左右，冠径1.5米左右，控制树冠一般的做法是：
一是及早促花，早结果。“以果压冠”主要通过配方施肥，抹芽控梢、扭转、控枝（压枝）来解决。
二是及时落头开心。中心主枝达到2米左右高度后，便要及时落头，若生长过旺，可先采取环割，促使其成花结果再落头，打开“天窗”，增加直射光照。
三是冠幅达到和超过应占范围时，对外围枝条不宜进行短截，否则越截越旺，一般要采用缓放，春夏及时抹芽摘心辅以环割、扭枝等措施促其开花结果后再重度回缩。
三、木瓜修剪应注意什么问题
短截是木瓜修剪的一个重要方式，但忌随心所欲地使用此法，否则会造成营养生长过旺，不能达到预期目的。
对于着生在中下部，处于生长劣势地位的枝条，一般不进行短截，让其白然转化为结果枝，如空间较大，适宜培育结果枝组的，可选留2-3个稍壮实的芽头后短截。
对于树冠顶端和外围生长强旺的枝条，不能在剪口内留壮芽，一般可在隐芽和弱芽处下剪，而对于那些对树形没有太大影响的枝条可在其生长季节采取抹芽、摘心等方法予以控制，使其转化为结果枝。
四、木瓜的树型问题
自然生长的木瓜树一般3根以上丛生在一起，通过人工干预可以形成白然开心形，这样的树冠类型，干枝最好在3根，最多不宜超过5根，向不同的方向伸展，形成通风透光，结果面大的良好树形。
新建的专业木瓜园，由于加大了密度，而且须单株培育，一般难以满足自然开心形的要求，通过近十年的探索，发现塔形和锥形（纺锤形）最具丰产潜力。
1、塔形
仿照乔木果树的疏散分层形进行培养，有中心主干，其分层层次超过三层，最终可达到五层，每层2-4个大分枝和4-5个结果枝群（着生于主干上的短果枝）。
2、锥形
也可称之为纺锤形，无明显分层，沿主干白下而上培育10-15个骨干枝和数量不限的短果枝，在树冠白地面至顶端1/4-1/3处培育出3-5根最长骨干枝以“纺锤”最粗部分，向上、向下枝条依次渐短，上部2/3为锥形，下部1/4为倒锥形。
由于木瓜的灌木生长习性，中心主枝在向上生长过程中，并不能完全直立生长，常发生大幅偏离和弯曲，因此需要强有力的人工辅助（主要是插杆助直）。
