基孔肯雅热是一种病毒病，病初多以突然发冷后发热开始，出现头痛、恶心、呕吐、腹痛和腹泻，面部发红，伴有非常剧烈的关节痛；进入第二期，体温再度上升，呈双峰热。
随之，淋巴结肿胀，在躯干和四肢出现皮疹，出血点小而多，无广泛的融合性出血疹。皮肤、黏膜及胃肠道有出血斑或出血。
本病可致患儿死亡，对成年人不发生休克综合征和死亡，但呈严重的肌肉和关节痛，有时会使病人在数分钟至数小时内完全丧失活动能力。恢复期长，关节痛可持续数月至1年。
在亚洲，其病毒感染的宿主范围较广，疫源地分城市型和丛林型，主要分布在非洲，以及亚洲的印度、马来西亚、泰国、缅甸、越南、老挝等地区，日本也曾有报道。
随着人和动物的快速移动和气候变化引起蚊子分布变化，本病似有北移现象。在自然疫源地，传染源主要是受感染的动物、病人和野生灵长类动物，他们是病毒的主要宿主，其他还有牛、马、羊、猪、兔、猫、鸡、蝙蝠等。
野栖蚊是重要媒介，人仅在进入丛林才可被感染。而城市型疫源地，受感染人是主要传播源，并通过伊蚊在人与人间及动物间传播。在本病流行期间，亚临床感染宿主，如猪、牛、马、羊、小鸡、猫等，感染后虽不出现症状，但成为重要的传染源。
现已经证明，白蚊伊蚊、埃及伊蚊、东乡伊蚊、三列伊蚊、伪盾纹伊蚊等是本病的传播媒介。而埃及伊蚊、白蚊伊蚊和东乡伊蚊在我国南部沿海地区、云南等地分布很广，需要警惕该病传播。
目前尚无预防本病的疫苗，控制本病只能是切断传染源和消灭传播媒介。灭蚊是重要措施，根据猪场用微生物作发酵床的研究，可大量减少蝇蚊，这可能是畜牧场灭蚊的一个方法和途径。