萝卜制种分为常规制种和一代杂交制种。常规制种就是同一品种萝卜进行大量的繁殖，提供萝卜生产用的种子；一代杂交制种，主要是利用萝卜雄不育系配制生产出性状更优秀的品种。
常规制种方法有成株采种法、半成株采种法及小株采种法。
(1)成株采种法
就是在萝卜的生长季节，一般是在秋季等到萝卜完全长成熟即萝卜肉质根充分膨大后，这时萝卜的外观、口感完全表现出来了，选择品质最好的萝卜留作种用，用地窖储藏。
将萝卜分层码放在地窖中，一层萝卜、一层土，最后将萝卜用薄薄的土覆盖，可以使萝卜越冬时免受冻害。
霜冻时，在地窖上面还要铺上厚草苫，到第二年春天萝卜完成了春化，就可以从地窖中取出，定植到大棚中了。定植是整地起垄，根据萝卜品种选择适当的株距，挖窝将种萝卜埋进去，深度以刚好埋下萝卜为准。浇水施肥，以后的田间管理和普通萝卜种植完全一样。
(2)半成株采种法
所谓半成株采种法，就是比栽培萝卜晚播种15～30天，采收的时候萝卜肉质根还没有充分膨大，但是已经呈现出品种的特征。
选择优良的种株，在地窖内贮藏，完成春化作用，在第二年的春天进行移种。移植方法和成株移植的方法一样，只是种植密度要比成株采种法大2～3倍，从而使单位面积的土地制种量更大。另外，半成株生命力也比较强，所以种子的产量高。
但该方法是在肉质根还没有充分膨大时选择种株，萝卜的性状未能充分表现，难以严格淘汰种性不良的植株，种子纯度不如成株采种法的高。一般用于原种及生产用种的繁殖。
(3)小株采种法
小株采种法是先栽种萝卜小苗，让它成熟后开花结子。要让萝卜开花，必须让萝卜经过春化过程，也就是在萝卜萌动期要经过3～5℃的低温处理。因此，选择在早春将种子播种于阳畦内，温度过低时可以在阳畦上盖上厚草苫，利用早春的低温使萌动的种子及幼苗通过春化阶段。
经过春化处理的小萝卜苗，长大后就可以移植到大田了，移植后及时浇水，以后的田间管理和普通萝卜种植基本一样，一般在春末夏初就可以开花结种了。
这种萝卜制种方法生育期短，省工省地，适于密植，单位面积种子产量较高，降低了种子的生产成本；但春天播种的是萝卜种子，对种株的经济性状不能进行很好地选择。另外，同一品种的萝卜使用这种方法，连年采种会引起种性的退化。因此，该方法仅适用于生产用种的繁殖。
