从各地生产实践来看，双孢蘑菇不覆土不能出菇，或很少出菇。有关双孢蘑菇覆土出菇的研究，已有很多报道，综合起来有以下几种观点。
(1)保护作用
双孢蘑菇菌丝长到一定阶段，就要进行覆土，在床面和培养料层形成局部小气候，防止培养料的温度和湿度发生急剧变化，保护菌丝的正常生长发育。
(2)转化作用
双孢蘑菇从营养生长转入生殖生长阶段，可能与覆土后两方面的因素改变有关：
①改变了培养料中二氧化碳的浓度。由于双孢子蘑菇的菌丝体和子实体对二氧化碳浓度需求各异，二氧化碳浓度增加会抑制菌丝生长，促进菇蕾形成。
②改变了营养条件。蘑菇菌丝原来的培养料营养条件较好，转入到营养条件较差的覆土层后，这种环境不利于菌丝体的营养生长，却有利于转化到出菇的生殖生长。
(3)促进作用
覆土后土层中有许多微生物，其中一些有益的微生物如假单孢杆菌等，它们的代谢产物是多种有活性的物质，能促进蘑菇子实体的形成。
(4)保水作用
培养料上面覆土后，能起到保水作用，有利于蘑菇子实体的发育和肥大。
(5)刺激作用
类似香菇出菇前要经过挪动和击打等过程一样，蘑菇的覆土过程，可能也是一种机械刺激作用，促进出菇。
(6)支撑作用
蘑菇子实体出土后，覆土层对它有支撑作用。
根据以上的观点，为了充分发挥覆土层对蘑菇的结菇作用，对覆土的材料要求是，吸水和保水性能好、毛细孔多、疏松、透气性好、不易板结等；营养贫瘠、肥分少、无病虫和杂菌等，须有能诱导出菇的一些微生物。
欧美等国蘑菇覆土材料多以泥炭为主，我国则因地制宜利用菜园土、河泥砻糠、细土砻糠等。
