黑木耳和毛木耳都属于木耳科、木耳属的真菌，外形相似，颜色也比较接近，消费者不容易辨别，容易买错，现在把两者的主要区别介绍如下。
(1)外形的区别
①黑木耳较小，直径3-10厘米；毛木耳较大，直径8-15厘米。
②黑木耳的耳片薄，厚度为0.8-1.2毫米；毛木耳的耳片厚，厚度为2毫米左右。
③黑木耳耳片背面有短毛，毛细短，长40-50微米，近乎光滑，所以黑木耳也叫光木耳；毛木耳反面的毛粗而长，长达400-500微米，是黑木耳的10倍左右，这是黑木耳与毛木耳的主要区别。根据毛木耳背面绒毛颜色的不同，又有黄背木耳和白背木耳之分。
(2)口感的区别
由于质地不同，黑木耳吸水性好，泡松率可达到1：10左右，泡发后质地嫩、滑、黏、糯，口感好，被誉为“素中之荤”；毛木耳的泡松率仅为1：8左右，质地硬而脆，较耐嚼，口味不及黑木耳，一般适于冷拌，所以有“树上海蜇皮”之称。
(3) 营养价值和保健功能
黑木耳与毛木耳营养价值和保健功能基本相似，但各有千秋。黑木耳含有的腺苷有降血脂、血黏度作用，可抑制血小板凝聚、防止血栓形成，缓和冠状动脉粥样硬化。
专家认为，常吃黑木耳可以起到每天服用阿司匹林的功效。毛木耳绒毛中的多糖有防癌抗癌作用，被认为是抗肿瘤活性最强的6种药用菌之一，所以毛木耳在日本和欧洲市场受到青睐。
此外，由于毛木耳的抗逆性强，生长速度快，栽培相对容易，产量高，价格也比黑木耳便宜，在我国南方有相当大的栽培面积。
