石榴品种对其耐贮性有一定影响。通常条件下，一般来说晚熟品种耐贮性能比较好，而早熟品种一般是不耐贮的品种。造成这种现象的原因，归根结底是由于基因型不同决定的。
晚熟品种一般会积累较丰富的营养物质，因此当采摘后会拥有较强的抗衰老能力，贮藏过程中对低温的适应性也会较好，因此可以相对稳定地维持生理代谢在正常水平，即使贮藏条件不适宜时，也可以很快地对自身呼吸作用进行调整，产生积极的保卫反应，因此比早熟品种更耐藏。
石榴的耐性在很大程度上也和石榴的生物学特性有很大关系，原因主要有以下几方面：
1、石榴的体积越大，与环境的接触面越大，就越容易受到所在环境中不利因素的影响，如发生机械损伤和微生物入侵的几率会增多；同时由于蒸腾作用的影响，体积越大失水就会越严重，水分的流失主要是在气孔中进行的，气孔密度越大，水分蒸腾速度越快，石榴就越容易失水、萎蔫，失去新鲜度，最直接的损失就是质量减轻，影响经济效益。
其次当组织内水分含量下降的时候，也会引起水解酶活性的升高，会加快对有机物的水解，增强石榴呼吸作用，进而影响藏期，气孔对石榴保鲜有不利影响。在石榴贮藏的过程中，不仅水分会在气孔中流失，造成石榴新鲜程度的下降，而且还会成为微生物入侵的主要通道，造成石榴的腐烂。
2、石榴耐贮性因品种和栽培环境的不同而有所差异。早熟、味甜的品种一般贮藏性较差，如突尼斯软籽石榴等。石榴品种皮越厚、籽粒含酸量越高，越耐贮藏，即厚皮石榴比薄皮石榴耐贮，酸石榴耐贮性优于酸甜和甜酸石榴，甜石榴耐贮性最差。
3、从籽粒软硬看，耐贮性软籽最差，其次为半软籽，硬籽石榴最耐贮；从石榴着色来看，红皮红籽石榴耐贮性优于白皮白籽石榴。另外，气候干燥地区生产的石榴较耐贮藏。
