木瓜的繁殖方式分为有性繁殖（种子繁殖）和无性繁殖（分株、扦插、压条）。
用种子育苗，苗期较长，主要在育种时采用，一般不被采用，这里亦不作详细介绍。在实际生产中，木瓜一般采用分株、扦插、压条三种方式进行，下面我们分别介绍一下。
一、木瓜的分株繁殖
木瓜是灌木植物，根颈下部易产生蘖苗，在土层下部生出蘖苗的基部长出根须，可直接选留健壮蘖苗培育两年以上，至蘖苗主干变成褐色，基部根系较为发达（3条以上须根）时从母树基部用斧凿、刀铲等工具进行分离即成。
此外，为了集中育苗，也可将所有蘖苗从母枝分离下来，剪成40-60厘米带蹄（俗称马蹄子）“胚苗”，通过生根剂处理后在事先备好的苗床上育苗，至1-2年“蹄”上根系形成，有3-5个分枝后进行移栽定植。
二、木瓜的扦插繁殖
木瓜扦插分硬枝扦插和嫩枝扦插。嫩枝扦插技术难度大、设备要求高、不常用，这里重点介绍硬枝扦插。
枝条采集与处理。于秋季落叶至春季萌芽前，选取优良植株上发育充实、无病虫害且较为光滑平直的1年至多年生枝条，剪成15-20厘米长的插穗，每段2-3个节，上端截平，下端于近芽节处削成马耳形斜面后浸入吲哚丁酸1000-2000倍溶液中10-15分钟，浸时不必整枝放入，只须直立淹至削口上5-10厘米即可，用其他生根剂处理插穗的，按其说明书使用。
苗床整理及扦插。苗床大小及长宽度根据育苗规模而定，以便于操作管理为原则，苗床不宜用肥土也不宜施入化学肥料，可混入少量腐熟细化的有机肥，将床面耙细整平，扦插前在床面按行距20厘米，横向开20厘米深的沟，再将经过处理的插穗按10厘米株距斜插入沟中，插穗之间同向平行，留一个节在地面以上填土压实，浇水盖草。
三、木瓜的压条繁殖
每年春、秋季，选品质优良、母树兜萌蘖多而健壮的木瓜树为母树，挖松土壤，将丛生的萌蘖苗逢节间刻伤树皮（深至木质部）后弯曲压入土内，用竹叉或其他方法固定覆盖细土，施适量腐熟有机肥，一个月后可在节间长根，并逐步陆续长出新的芽苗，培育半年以上分离母体，可分离出一根乃至多根新的苗木，可直接定植，也可经假植一年后定植。
此法虽成活率高，但不便操作，而且批量小，一般很少采用。
