农药残留限量标准是根据农药的毒理、该农药在农产品中的残留量及消费者的膳食结构等数据，进行膳食摄入风险评估而制定的。
从技术上来说，因不同的国家，农药的使用情况不同，气候与土壤等环境条件有很大差异，同一种农药在同一种农产品中的残留量是不一样的。加上各国的食物结构也有很大不同，因此，各国制定的农药残留限量标准是不相同的。
另外，尽管各国制定限量标准的主要目的是为了确保食品安全，但为了保护本国利益，各国越来越多地将农药残留作为农产品国际贸易的技术壁垒，会根据利益需要，制定本国的农药残留限量标准。
一是对本国不生产或不使用的农药，往往制定更严格的残留限量标准。如杀菌剂克菌丹和高毒农药甲基对硫磷的生产国日本，对其在稻谷中的残留限量分别规定为5mg/kg和1mg/kg，而不生产这2种农药的欧盟都规定为0.02mg/kg，分别相差250倍和50倍。
二是对本国没有或主要依靠进口的农产品，制定的农药残留限量标准较严，而对本国生产、特别是出口的农产品，标准则较宽松。如欧盟对新杀虫剂氯虫苯甲酰胺的残留限量，在大米等粮谷和茶叶上分别规定为0.01mg/kg和0.02mg/kg，而在葡萄上则为1mg/kg。因为对欧洲来说，粮谷和茶叶是主要进口农产品，要求标准严；而葡萄是优势作物，虽可鲜食，但标准要求反而较松。
目前，我国的农药残留限量标准，有的比发达国家低，有的比发达国家高。如我国规定马拉硫磷在柑橘、苹果、菜豆中的残留限量为2mg/kg，在糙米中为1mg/kg，在萝卜中为0.5mg/kg，均严于美国8mg/kg的限量标准。
为了协调和统一标准，国际食品法典委员会(cac)负责制定农药残留限量国际标准。我国是cac农药残留标准委员会的主席国，农药残留限量标准尽可能与cac法典标准接轨。
