菠菜中含有一定量的草酸，其含量受多种因素影响。过量的草酸会影响人体对钙的吸收。减少菠菜中草酸含量可提高其营养品质，可通过合理施肥、控制成熟度等方式实现，选育低草酸品种也很重要。
草酸乃是菠菜产生涩味的关键来源。相较于其他蔬菜，菠菜所含的草酸量颇高。若人体过度摄取草酸，它将与钙相互结合，形成难以溶解的草酸钙并沉淀下来，肠道无法吸收，随粪便排出，进而对钙的吸收造成影响。
事实上，菠菜的含钙量虽说相对较高，每100克鲜重中就含有103毫克的钙，即0.103%，然而菠菜中的总草酸含量更为可观，通常处于0.5%至1.5%的范围。因此，降低菠菜中的草酸含量，亦是提升菠菜营养品质的重要环节之一。
菠菜中的草酸含量在不同的品种、栽培季节以及收获期存在不稳定的变化，目前尚未得出确凿的结论。然而，一些试验表明，大量施用氮肥，尤其是硝态氮肥，不仅会使总草酸含量上升，还会提高水溶性草酸对不溶性草酸的比例；增加磷、钾肥的施用，减少氮肥的使用，提供充足的水分，则可降低水溶性草酸的含量；总草酸含量会随着菠菜植株成熟度的提高而降低；冬季有利于草酸的产生和积累。
由此可见，避免大量施用氮肥，特别是硝态氮肥，并适当提高菠菜采收时植株的成熟度，对于减少菠菜的硝酸盐含量和草酸含量都是有益的。
此外，在菠菜品种的选育工作中，也应将草酸含量低列为选育目标之一。
