由于粪便中含有大量的有机物质，故可以用作肥料、饲料、沼气发酵等。
(1)用作肥料
牛粪便可直接施用，也可经腐热堆肥和药物处理后再施用。
①直接施用（土地还原法）：新鲜的牛粪便可直接施入农田，每亩地可施鲜粪20吨。但用鲜粪施肥时，粪便施入后应立即翻耕，埋入土中，不致造成恶臭四溢，产生污染。
②腐热堆肥法：将牛粪与作物秸秆（稻草、麦秸、玉米秸等）按1:1～1:2混合，在厌气微生物的作用下将有机物分解。在此过程中放出的热量可杀灭粪便中的病原微生物与寄生虫卵等，并可提高肥效。将牛粪与垫草（稻草、麦秸、玉米秸等）按1:1.5混合，水分宜控制在40%左右。在向阳、干燥地面上挖纵横交叉的小沟，沟宽深各15厘米。在沟上用树枝或竹板铺垫，然后用玉米秸竖立于堆底，将混匀的粪便与垫料逐层向上堆砌。堆好后用泥密封，待泥稍干后将玉米秸抽出，形成通风口．15～20天后发酵腐熟完毕。
③药物处理：在钩虫病、血吸虫病等流行地区，可用药物对粪便进行处理，50%敌百虫每100千克粪便2克，处理1天或15%尿素处理1天或1%的硝酸铵处理3天。
(2)生产沼气
沼气是利用厌氧菌（主要为甲烷菌）对粪尿进行厌氧发酵，产生甲烷(60%～70%)与二氧化碳(25%～40%)，还有少量的氧、氢、一氧化碳和硫化氢等。生产的主要条件，保持无氧条件原料的碳氮比按1：1加入，保持20～30℃的适宜发酵温度，池液ph为7～8.5。
(3)用作饲料、肥料
肉牛粪便中含有较丰富的成分，每头牛每年排出的粪便中，有机物含量5580千克、粗蛋白79千克、总消化养分251千克，相当于200千克豆饼所提供的蛋白质。牛粪加工成饲料，常用脱水干燥、青贮、化学处理、物理处理方法，以及氧化沟、活性污泥法、培养蚯蚓等生物处理法。
①脱水干燥：粪便干燥最为简单，干燥后的粪便仅有原体积的20%～30%。
②青贮：粪便的青贮与干燥法相比，既节省能源，又可保持粪便中的营养物质，对于设施的要求比较简单。牛粪可以与玉米、棉籽饼及麸糠皮等按一定比例混合后，保持水分在40%～65%，并有足量的可溶性碳水化合物，可取得良好的青贮效果。国外研究表明，用57%～60%的牛粪肥和40~6～43%干草组成的混合物进行青贮。
