(5)有机稻田培肥施肥
有机水稻生产中提倡种植豆科作物或绿肥进行土壤培肥。主要的培肥措施包括：与油菜、绿肥、玉米、大豆等轮作；秸秆直接还田、腐熟还田、过腹还田等；增施农家肥、堆肥、沼肥等有机肥；稻田养鸭、鱼、蛙等。提倡采用休闲恢复土壤肥力。生产基地中使用的所有肥料应对作物和环境无害，这些肥料应以来自有机生产基地体系为主。
(6)收获和贮藏
有机水稻应单独收获。收获前应对机械设备进行清理，以免对稻谷造成污染。稻谷的容器和包装材料宜使用可重复、可回收和可生物降解的材料，不应使用接触过禁用物质的包装物或容器。
有机稻谷应尽可能单独贮藏。若与常规产品共同贮藏，应在贮存场划出特定区域，并采取必要的包装、标识等措施，防止有机稻谷与非有机稻谷混合。
