2、中耕除草
黄芪幼苗生长缓慢，出苗后往往草苗并长，若不注意，很易造成草荒，因此应及时除草。除草工作要与中耕相结合。中耕可疏松土壤，切断土壤毛细管，防止水分蒸发，起到防旱保墒的作用；大雨和久雨之后，中耕又起到散墒除涝的作用；苗高7—8厘米时进行第一次中耕，定苗后进行第二次中耕。
中耕深度一般按苗期浅，成株深，苗旁浅，行中深的原则进行，做到不伤苗，不埋苗，不伤根，不留草。第二年以后的4月、6月、9月各中耕一次。根据山东菏泽市润康中药材研究所种植经验，结合“gap”规范化生产要求，在杂草较多的幼龄期，可以用黄芪专用除草剂喷杀一次（除草剂每年只能用一次），基本保证田间无杂草。
3、肥水管理
为了满足不同生育期对养分的需要，提高产量，在生长的当年和第二年，每年结合中耕除草追肥2次。第一次追肥结合第二次中耕除草进行，每亩用堆肥1500千克、过磷酸钙50千克、硫酸铵10千克混合均匀后在行间开沟施入，施后覆土。第二次在入冬苗枯后每亩用厩肥2000千克加过磷酸钙50千克、饼肥150千克后混合拌匀施入田间，施后培土防冻。
黄芪苗期耗水量少，为促进根系下扎，增加根部长度，提高黄芪产量，在足墒播种的情况下，可以不浇水。若底墒不足，天气干旱，应用小水或隔行灌溉，切勿大水漫灌。
在结果种熟期，如遇高温干旱，也应及时灌水，促使种子正常成熟，降低硬实率，提高种子质量。雨季土壤湿度过大，会导致根部腐烂，易积水的地块应注意及时排水，降低土壤湿度，以利根部正常生长。
