另外，一些不同的病原还能够引起相同症状的疾病，如新城疫、传染性支气管炎、传染性喉气管炎、禽流感、鸡毒支原体感染、传染性鼻气管炎、大肠杆菌病、禽痘、肿头综合征、马立克病、禽霍乱、曲霉菌病、开口病、气囊螨虫病、氨中毒、福尔马林中毒、维生素a缺乏、腹水症等，都有可能引发呼吸道症状。
这些病原的混合感染屡见不鲜，而单一接种某种疫苗的免疫效果往往也不理想。马立克病、传染性法氏囊病、白血病以及网状内皮组织增生症等，还能够引发免疫抑制。
5、疫苗、兽药质量欠佳，免疫效果不佳
由于生产设备的陈旧、生产工艺的落后，我国的兽用疫苗和兽药质量与发达国家相比存在着巨大的差距，有众多产品达不到gmp标准。再加上对兽药市场的监督不力，致使大量假冒伪劣药品流入市场，给禽病的防治带来了极大的困难。
另外，对于一些新的病原、变异株以及出现的强毒株的研究相对较少，无法生产出有效的疫苗以供生产使用。免疫方法不够科学，在免疫程序和剂量的选择上比较盲目，针对性不足。尤其是在出现新病原、变异株以及混合感染的情况下，更是重复进行免疫、全面用药，造成了不必要的浪费，而且免疫效果也不尽如人意。
