大蒜生产中存在的问题很多，有的属于生理异常现象，有的属于栽培技术不当；有的带普遍性，有的则是在少数地区、少数年份发生。
其中发生最普遍、对大蒜生产影响最大的问题是大蒜二次生长，其他还有管状叶、裂球散瓣、抽薹不良、瘫苗等。
大蒜二次生长是蒜头收获前蒜瓣就萌发生长的异常现象。国内外对这种现象采用的名词很多，除二次生长外还有次生蒜、马尾蒜、胡子蒜、分株蒜、分杈蒜、背娃蒜、复瓣蒜、再生叶薹、收获前萌发、母子蒜、分球、带侧枝蒜等。
根据二次生长在大蒜植株上发生的部位，分为以下三种类型。
(1)外层型二次生长
大蒜植株外层叶片的叶腋中萌生1至数个鳞芽，鳞芽延迟进入休眠而继续分化和生长，形成独瓣蒜，或没有花薹的分瓣蒜，或有花薹的分瓣蒜，结果在蒜头的外围着生一些排列错乱的蒜瓣或小蒜头，使整个蒜头成为畸形。这种类型的二次生长对商品品质的影响最大。
(2)内层型二次生长
在大蒜植株内层叶片的叶腋中，正常分化的鳞芽延迟进入休眠，鳞芽外围的保护叶继续生长，从植株的叶鞘口伸出，形成多个分权。
有的分杈发育成正常的蒜瓣；有的分权发育成分瓣蒜，其中有少数分瓣蒜还形成了花薹。
轻度的内层型二次生长对蒜头的外形影响不大，发生严重时，蒜薹变短，薹重降低，蒜瓣排列松散，蒜头上部易开裂，所形成的分瓣蒜外观酷似一个肥大的正常蒜瓣，常被选作蒜种，但播种后由一个种瓣中长出2至多株蒜苗，从而影响所生蒜头的产量和质量。
(3)气生鳞茎型二次生长
蒜薹总苞中的气生鳞茎延迟进入休眠而继续生长成小植株，甚至抽生细小的蒜薹。发生气生鳞茎型二次生长的植株，常使蒜薹短缩，丧失商品价值，但对蒜头的影响不大。这种类型的发生率一般很低。
除了上述三种基本的二次生长类型外，有时在同一植株上还会出现两种类型混合发生的情况。
