众所周知，杂交种子在长势、繁殖抗病虫方面都有很大优势，称其为杂交优势。
杂交苦瓜种与常规苦瓜种相比，根、茎、叶、花表现出突出优点。
(1)根
杂交苦瓜根系发达、活力强，侧根多，根群分布直径180厘米以上，深度25厘米以下，为整个品种耐低温，抗干早以及提高土壤养分利用率奠定了基础。
(2)茎
杂交苦瓜的主蔓上的芽活动能力强，易发生侧枝、二级侧枝，但三，四级侧枝发生缓慢﹐所以优良的杂交种茎蔓密而不乱，克服了常规种三、四级恻枝活动能力强、无效细弱茎蔓过多、空间郁蔽等缺点。
(3)叶
杂交苦瓜的叶片堕度是常规种叶片厚度的1.5～2倍﹐面单个叶片的面积是常规种的2～3倍。因此，杂交苦瓜的光合利用率显著高于常规种。
(4)花
常规种在经过幼苗期后，无明显的抽蔓期，一般直接进入开花结果期。在生产中，无论这些花进行授粉与否，都会吸收大量养分，降低苦瓜植株的活力，从而长势相对较弱，抗病能力低，易产生畸形瓜或瓜形不稳定，且给中后期的高产、稳产制造了较大的障碍。
而杂交苦瓜品种在幼苗期后有明显的抽蔓期，抽蔓期间生长旺盛，整个植株体迅速增大，营养积累多。抽蔓期结束后，才进入开花结瓜期，在此期间雌，雄花明显增多，在充足且稳定的水分、营养供给下，雄花花粉活力好，雌花坐瓜稳定，瓜条顺直、整齐。
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优良的杂交苦瓜种还具有以下优势：
(1)营养生长旺盛，为中后期高产奠定了基础。
(2)生殖生长稳健，连续结瓜能力强，坐瓜率高，雌花利用率高。
(3)瓜条商品率高，瓜形稳定、大小均匀，畸形瓜少；膨瓜速度快，采摘天数间隔短﹐采摘频率高。瓜肉厚﹐硬度好，老化慢，货架期﹑保鲜期长。
(4)抗病能力强，尤其对白粉病﹑炭疽病、病毒病等有很高的抗性，减少了农药的用量，降低了生产成本和劳动强度。
