核桃的药用价值很高，中医认为，核桃适用于肾亏腰痛、肺虚久咳、气喘、大便秘结、病后虚弱等证，把核桃焙烧吃，可治疗痢疾。
民间还有核桃仁、生姜同用治肺肾两虚、久咳痰喘（包括老年慢性支气管炎、咳喘、肺气肿等），对慢性支气管炎和哮喘病患者疗效极佳。以核桃隔与芡实、薏米仁同用治肾虚、小便频数、遗精、阳痿、痘疮不起浆及慢性化脓病等。核桃油可作缓下剂，并能驱绦虫，外用皮肤病如冻疮、疮癣、腋臭等亦有疗效。
现代医学研究认为，核桃中的磷脂有补脑健脑作用。核桃仁中含量较高的谷氨酸、天冬氨酸、精氨酸，对人体有着重要生理功能。
精氨酸在人体内有助于苏氨酸循环，在人体肝脏内将大量的氨合成尿素，再由尿排出以解氨毒，所以精氨酸具有解毒、恢复肝脏功能的特殊生理作用。
核桃仁中不饱和脂肪酸主要为亚油酸和亚麻酸，这2种脂肪酸不仅有较高的营养价值，而且还具有一定的药用功效。
亚油酸、亚麻酸是体内合成前列腺和pge的必需物质，pge有防血栓、降血压、防止血小板聚集、加速胆固醇排泄、促进卵磷脂合成、抗衰老的特殊功效。
核桃在我国古医药中应用广泛。李时珍《本草纲目》记述“补气养血、润燥化痰、益命门、利三焦，温肺润肠。治肺润肠。治虚寒喘咳，腰脚重痛，心腹疝痛．血痢肠风，散肿毒……”
宋刘翰《开宝本草》载“胡桃（即核桃）味甘、平、无毒。食之令人肥健，润肌黑发，取瓤烧令黑，未断烟，和松脂，研傅瘰疬疮”。
崔禹锡的《食经》说它“多食利小便，去五痔”。《医林纂要》一书的评价是，可以“补肾、润命门、固精、润大肠、通热秘、止寒泻虚泻”。可见，我国人民对核桃的营养价值和医药功能，很早就有深入的了解。
核桃本身对内、外伤、妇、儿、泌尿、皮肤等科的几十种疾病均有治疗作用。如核桃油治耳炎、皮炎和湿疹，制得的馏油对黄水疮等具有显著疗效；油炸核桃仁加糖类治疗泌尿系统结石已被多处临床所肯定。
