农业防治是农作物病虫害综合防治工作中的基础环节，其实质就是农事活动中尽量考虑到病虫害防治因素，结合农事操作，降低病虫基数或切断病虫害的传播链，从而达到病虫害控制的目的。
农业防治的措施主要包括选用抗（耐)病虫品种、用无病种子或进行种子消毒、清洁田园、适时播种、合理轮作、间作、套种、深耕晒田、科学施肥等。
农业防治不仅不需要过多额外的投入，而且使农事活动更加科学合理，在生产中意义重大。在农业防治中尤其要强调以下几个方面的工作：
1、清洁田园
病虫多数在田园的残株、落叶、杂草或土壤中越冬、越夏或栖息。在药材播种和定植前，结合整地收拾病株残体，铲除田间及四周杂草，拆除病虫中间寄主。在生长过程中及时摘除病虫危害的叶片，或全株拔除，带出田外深埋或烧毁。
2、合理轮作、间作
连作是引发和加重病虫为害的一个重要原因，在生产中按合理的种植布局，药材品种实行有计划的轮作倒茬、间作，既可改变土壤的理化性质，提高肥力，又可减少病源虫源积累，跟轻危害。水旱轮作可明显减轻各种病虫害的发生。
3、深耕
深耕可将土表的病残体、落叶埋至土壤深层腐烂，并将地下的害虫、病原菌翻到地表，受到天敌啄食或严寒冻死，从而|低病虫基数。而且使土壤硫松，有利于药材根系发育，提高植株抗逆性。
4、用无病种子或进行种子消毒
以根、茎等营养器官为繁殖材料的药材品种，应尽量选用无病虫或病虫害发生轻的田为留种田，播种前进行表面消毒处理。直接播种籽粒的药材品种，播种前可进行拌种处理。例如，黄芪种子播前用种子重量1%～2%的50%多菌灵可湿性粉剂拌种，可有效降低根腐病害的发生。
