苹果锈果病的病原在病树中越冬，主要靠带病接穗、砧木通过嫁接传播，嫁接过程中的刀、剪、锯等嫁接工具及害虫也是重要的传播途径。
苹果锈果病目前尚无有效的防治方法，因此对该病的防治要以预防为主：
(1) 培育无毒苗木
(2) 选用无病接穗和砧木培育无毒苗木，或通过茎尖脱毒处理培育无毒苗。
(2)避免与梨树混栽
新建苹果园应避免与梨树混栽，更要远离梨园150米以上。
(3)挖除病树
苗木生长期间，认真检查苗圃，发现病苗及时拔除、烧毁。果园内发现病树应连根挖除，1～2年后，确认无活根，再补栽健树。
(4)加强管理，培育壮树
合理施肥，科学修剪，及时防治其他病虫害。
(5)药剂防治
①半环割包药：在主干韧皮部割“门”字形切口，上涂50万单位的四环素，或150万单位的土霉素、链霉素、灰黄霉素等，然后用塑料薄膜包裹，可减轻病害发生。
②灌根防治：用宁南霉素加四环素或链霉素各50～100毫克／千克，再加硫酸锌或硼砂各300倍的混合液灌根，每棵树25～50千克。处理时间可在4月、6月及8月各进行1次。
③喷雾防治：在花蕾露红期及谢花后，喷施1.35%三氮唑核苷铜可湿性粉剂1000倍液进行预防和控制病害。
核心提示：梨树是该病的带毒寄主，虽然梨树不表现症状，但与梨混栽或靠近梨园的苹果树发病较重。苹果不同品种间的抗病性差别也较为明显，如金冠、祝光较为耐病，国光、元帅、红星等品种易感病。
